Przeprowadzone w ramach projektu badania obejmowały
Transkrypt
Przeprowadzone w ramach projektu badania obejmowały
Nr wniosku: 202974, nr raportu: 19342. Kierownik (z rap.): dr hab. Magdalena Frąc Przeprowadzone w ramach projektu badania obejmowały następujące cele badawcze: ocenę występowania grzybów termoopornych (Neosartorya i Byssochlamys), w glebach oraz owocach pochodzących z plantacji truskawek; optymalizację metod szybkiej detekcji grzybów termoopornych (Neosartorya i Byssochalmys); charakterystykę molekularną i metaboliczną wybranych izolatów grzybów termoopornych. Badaniami objęto 17 plantacji truskawek zlokalizowanych na terenie województwa lubelskiego i mazowieckiego. W ramach przeprowadzonych badań zebrano kolekcję grzybów termoopornych, obejmującą 785 izolatów, z których wyselekcjonowano 50 szczepów, które poddano szczegółowej charakterystyce molekularnej i metabolicznej. Przeprowadzone badania wykazały, że grzyby termooporne z rodzaju Neosartorya występowały w glebie pobranej ze wszystkich plantacji przemysłowych, jednakże największy odsetek tych organizmów został wyizolowany z gleby brunatnej kwaśnej i torfu niskiego. Spośród 785 izolatów Neosartorya tylko 29% stanowiły grzyby wyodrębnione z owoców, głównie pochodzących z plantacji zlokalizowanych na glebie brunatnej kwaśnej i torfie niskim. W truskawkach pobranych z plantacji zlokalizowanych na glebach: płowych, brunatnych zwyczajnych, czarnych ziemiach, rędzinach czarnoziemnych oraz madach nie stwierdzono obecności grzybów termoopornych Neosartorya lub stwierdzono pojedyncze izolaty. Analiza uzyskanych wyników wskazuje, że plantacje truskawek zlokalizowane na glebie brunatnej kwaśnej i torfie niskim narażone są w większym stopniu na skażenie owoców przez grzyby termooporne. Wśród grzybów termoopornych wyizolowanych z gleby i owoców truskawki przeważał gatunek N. glabra. Ponadto, stwierdzono obecność trzech innych gatunków z rodzaju Neosartorya: N. laciniosa, N. assulata oraz N. spinosa. Wśród zebranych izolatów nie stwierdzono obecności gatunków N. fischeri i B. fulva. Przydatność techniki PCR do detekcji grzybów Neosartorya i Byssochalmys oceniano w szeregu eksperymentów, obejmujących szczepy wzorcowe, którymi zakażane były owoce truskawki, sok truskawkowy oraz gleba. Optymalizacja metody pozwoliła na detekcję grzybów w reakcjach prowadzonych dla poszczególnych gatunków, a także w reakcji typu duplex, podczas której wykryto jednoczesną obecność Neosartorya i Byssochlamys w truskawkach kontaminowanych tymi grzybami. W celu oceny przydatności techniki Real-Time PCR do oznaczenia stężenia grzybów w glebie przygotowano próby sterylnej gleby z dodatkiem oznaczonego stężenia zarodników Neosartorya i Byssochlamys. Detekcja była możliwa, gdy w 1 gramie gleby znajdowało się 100 zarodników. Specyficzność zoptymalizowanych metod detekcji grzybów termoopornych Neosartorya i Byssochalmys w glebie i truskawkach określono poprzez badania na próbkach zakażanych grzybami z rodzaju Aspergillus, Penicillium, Talaromyces i Fusarium. Obie metody okazały się wysoce specyficzne w detekcji grzybów Neosartorya i Byssochlamys. Analizy molekularne wybranych izolatów Neosartorya wykazały istnienie zróżnicowania genetycznego szczepów w zależności od rodzaju próbki, z której zostały wyizolowane (gleba, owoce truskawki). Analiza profilu metabolicznego wykazała, że u grzybów termoopornych charakteryzujących się wyższym czasem dziesięciokrotnej redukcji (wyższą termoopornością) zaobserwowano wzmożony katabolizm węglowodanów i obniżenie rozkładu związków azotowych (aminokwasów oraz amin i amidów). Przeprowadzone badania wykazały, że grzyby były bardziej oporne na wysoką temperaturę w pulpie truskawkowej niż w buforze, czego przyczyną było ochronne działanie cukrów zawartych w produkcie naturalnym. Badane izolaty grzybów z rodzaju Neosartorya nie produkowały mykotoksyn: werukulogenu i fumitremorginy C, typowych dla N. fischeri. W wyniku przeprowadzonych badań wykazano hamujący wpływ kwasu zaragozowego A, octanu talu(I) oraz selenianu sodu na wzrost N. fischeri. Biorąc pod uwagę fakt, że Polska jest liderem w globalnej produkcji owoców jagodowych, badania jakości surowca na każdym etapie produkcji, przetwarzania i dystrybucji są bardzo istotne w celu zapewnienia najwyższej jakości produktów i jeszcze większego umocnienia pozycji kraju na rynkach europejskich i światowych. Rezultaty projektu niewątpliwie wpisują się w wyżej wymieniony zakres, dostarczając wyników badań podstawowych o występowaniu, różnorodności i właściwościach grzybów termoopornych oraz metodach ich detekcji. Na podstawie uzyskanych wyników można sformułować zalecenie, dotyczące badań monitoringowych w kierunku obecności grzybów termoopornych Neosartorya w owocach pochodzących z plantacji zlokalizowanych na glebach brunatnych kwaśnych oraz torfach niskich. Z przeprowadzonych badań wynika, że selenian sodu stanowi potencjał jako aktywny fungicyd przeciwko gatunkowi N. fischeri, ze względu na fakt, że może być stosowany jako nawóz dla gleb ubogich w selen. Uzyskane rezultaty projektu są wyznacznikiem dalszych badań nad wpływem naturalnych wyciągów roślinnych i innych biofungicydów na termooporne grzyby Neosartorya, zwłaszcza te występujące na terenie Polski (N. assulata, N. glabra, N. laciniosa, N. spinosa).