0310- CH-S2-002 - Uniwersytet Śląski

Uniwersytet Śląski w Katowicach
Wydział
str. 1
Kierunek i poziom studiów: Chemia, drugi
Sylabus modułu: Przedmiot B związany ze specjalnością (0310CH-S2-002)
Nazwa wariantu modułu: Biochemia z elementami genetyki
(0310-CH-S2-L-057)
1. Informacje ogólne
koordynator modułu
rok akademicki
semestr
forma studiów
sposób ustalania
oceny końcowej
modułu
informacje
dodatkowe
prof. dr hab. Jerzy Silberring
2014/15
letni
Studia drugiego stopnia stacjonarne
Ocena końcowa modułu ustalana jest na podstawie oceny z konwersatorium (0,5) oraz
oceny z kolokwium zaliczeniowego z wykładów (0,5).
Ocena z konwersatorium wystawiana jest na podstawie liczby uzyskanych punktów,
maksymalnie 15 punktów, za przygotowanie i przedstawienie 3 prezentacji w grupach
maksymalnie 2-osobowych (3 × maksymalnie 5 pkt), zgodnie z kryteriami: 8 -9 pkt - ocena
dostateczna (3,0); 9,5 -11 - ocena plus dostateczna (3,5); 11,5-12,5 - ocena dobra (4,0); 1314 - ocena plus dobra (4,5); 14,5 - 15 - ocena bardzo dobra (5,0).
Ocena z kolokwium z wykładów wystawiana jest na podstawie liczby uzyskanych punktów,
maksymalnie 15 punktów, wg punktacji jak wyżej.
Dopuszcza się uzyskania pozytywnej oceny końcowej modułu przy braku pozytywnego
zaliczenia kolokwium z wykładów.
2. Opis zajęć dydaktycznych i pracy studenta
nazwa
kod
Wykład
0310-CH-S2-L-057
prowadzący
grupa(-y)
treści zajęć
_fs_1
prof. dr hab. Jerzy Silberring; dr hab. Piotr Suder; dr Anna Bodzoń-Kułakowska
2 grupy konwersatoryjne dla przedmiotu B związanego ze specjalnością
Zagadnienia poruszane na wykładzie:
1. Podstawowe grupy związków: kwasy nukleinowe, białka, cukry i lipidy. Budowa komórek,
tkanek i organizmów.
2. Aminokwasy jako podstawowe elementy budulcowe peptydów i białek. Leki peptydowe i
białkowe
3. Wiązanie peptydowe, peptydy terapeutyczne. Białka proste i złożone – struktura I-IVrzędowa, zależność pomiędzy strukturą i funkcją.
4. Hemoglobina – allosteria, hemoglobiny patologiczne, mutacje genów a patofizjologia.
5. Enzymy i inhibitory enzymów – mechanizm działania oraz ich inhibitory jako leki.
6. Węglowodany. Monosacharydy i disacharydy – właściwości fizykochemiczne i znaczenie
biologiczne. Polisacharydy – struktura a własności, choroby spichrzeniowe, cukrzyca.
7. Lipidy. Podział lipidów. Błony biologiczne – struktura i znaczenie, tratwy lipidowe. Rola
lipidów w organizmie – podstawowe przemiany. Defekty przemian lipidów – lipidozy, lipidemie.
8. Przemiany energetyczne w komórkach zwierzęcych i roślinnych.
9. Techniki biochemiczne: ekstrakcja, homogenizacja, dializa, chromatografia (HPLC),
elektroforeza, ultrawirowanie, spektrometria mas, metody obrazowania, zintegrowane systemy
analityczne, mikro-TAS).
Uniwersytet Śląski w Katowicach
Wydział
metody
prowadzenia zajęć
liczba godzin
dydaktycznych
(kontaktowych)
liczba godzin pracy
własnej studenta
opis pracy własnej
studenta
organizacja zajęć
literatura
obowiązkowa
literatura
uzupełniająca
adres strony www
zajęć
informacje
dodatkowe
nazwa
Konwersatorium
prowadzący
grupa(-y)
treści zajęć
str. 2
Wykład z użyciem środków audiowizualnych.
30
20
Student pogłębia wiedzę zdobytą na wykładzie w oparciu o literaturę dodatkową i
przygotowuje się do dyskusji i odpowiedzi na pytania dotyczące tematyki, poruszonej
na wykładach.
wykłady zblokowane
J.M. Berg, J. L. Tymoczko . 2005 i nowsze. Biochemia. PWN. Warszawa
R.K. Murray i wsp. 1995 i nowsze. Biochemia Harpera. PWN. Warszawa
P. C. Turner, A. G. McLennen i in. 1999 i nowsze. Krótkie wykłady Biologia
molekularna. PWN. Warszawa
B.D. Hames, N.M. Hooper, J.D. Houghton. 2002 i nowsze. Biochemia. Krótkie wykłady.
PWN. Warszawa
neuro.agh.edu.pl
kod
0310-CH-S2-L-057
_fs_2
prof. dr hab. Jerzy Silberring; dr hab. Piotr Suder; dr Anna Bodzoń-Kułakowska
2 grupy konwersatoryjne dla przedmiotu B związanego ze specjalnością
Tematy do opracowania prezentacji i dyskusji do wystąpień::
Enzymy
1. Pojęcie optimum temperaturowego i optimum pH dla działania enzymu,
omówienie na przykładach.
2. Inhibitory i aktywatory enzymów – podstawy, zasada działania
3. Strategie regulacji aktywności katalitycznej enzymów
4. Allosteryczna regulacja działania enzymów na dowolnym przykładzie
5. Strategie proteaz na przykładzie chymotrypsyny, trypsyny i elastazy
6. Inhibitory proteaz jako leki (np. terapia HIV)
7. Izozymy – definicja, przykłady, wykorzystanie w diagnostyce, metody analizy
8. Cyklooksygenaza – budowa, mechanizm katalizy i znaczenie (inhibitory, stan zapalny);
9. Biochemiczne podstawy działania kwasu askorbinowego jako witaminy;
10. Anhydraza węglanowa jako przykład metaloenzymu.
11. Bakterie Gram + i Gram – budowa komórki, charakterystyka ściany komórkowej
12. Lizozym – naturalny antybiotyk - budowa, mechanizm katalizy i znaczenie;
13. Penicylina - znaczenie i mechanizm działania;
14. Mechanizmy oporności bakterii na antybiotyki;
15. Bakteriofagi i terapia fagowa jako alternatywa dla antybiotykoterapii
Leki jako ligandy:
16. Budowa błony komórkowej i jej rola
17. Receptory G - Kofeina i teofilina substancje wpływające na przekaźnictwo sygnału z udziałem
cAMP;
18. Receptorowe kinazy tyrozynowe - szlak sygnalizacji insuliny
19. Onkogeny (białka src i ras)
Uniwersytet Śląski w Katowicach
Wydział
20.
21.
22.
23.
24.
str. 3
Wpływ agonistów i antagonistów na receptory (na przykładzie receptora opioidowego µ)
Metabolizm ksenobiotyków - faza 1
Metabolizm ksenobiotyków - faza 2
Problem uzależnienia i tolerancji na przykładzie morfiny
Mechanizmy przewodnictwa bodźców bólowych
Immunologia
25. Budowa przeciwciał
26. Choroby autoimmunologiczne (przyczyny i przykłady ogólnie);
27. Stwardnienie rozsiane
28. Problemy z przeszczepami (omówienie HLA);
29. Alergie;
30. Szczepionki – kiedy za, a kiedy przeciw?
Genetyka
31. Koniugacja, transfekcja, transdukcja
32. Leki pozyskiwane z użyciem GMO;
33. Terapia genowa – zasada terapii, za i przeciw.
34. PCR zasada działania i jego wykorzystanie w kryminalistyce i diagnostyce
35. Diagnostka z wykorzystaniem genetyki (Southern Blotting, FISH itd.)
36. Selektywne wyłączanie genów – tworzenie organizmów „knock-out” i ich wykorzystanie
37. Choroby jako wynik mutacji punktowych
38. Choroby wynikające z aberracji chromosomów
39. Optogenetyka
Metody stosowane w biochemii:
40. Proteomika
41. Metabolomika
42. Metody chromatograficzne w analizie białek
43. Elektroforeza żelowa i izoogniskowanie
44. Zasada działania i zastosowanie Western-Blottingu
45. Spektrometria mas
metody
prowadzenia zajęć
liczba godzin
dydaktycznych
(kontaktowych)
liczba godzin pracy
własnej studenta
opis pracy własnej
studenta
organizacja zajęć
literatura
obowiązkowa
literatura
uzupełniająca
adres strony www
zajęć
informacje
dodatkowe
Prezentacja, trwająca maksymalnie 10 minut, opracowanych tematów przez studentów i
dyskusja prezentowanych treści, modulowana przez prowadzącego z pozostałymi
uczestnikami konwersatorium.
15
75
Zebranie materiałów do prezentacji, ich analiza, przygotowanie prezentacji, jej
przedstawienie i dyskusja z pozostałymi uczestnikami konwersatoriów.
Jednostka zajęciowa: 2 godziny (po 45 minut) 6 razy w semestrze. Zajęcia odbywają się w
salach Instytutu Chemii przy Bankowej 14.
R.K. Murray i wsp. 1995 i nowsze. Biochemia Harpera. PWN. Warszawa
J.M. Berg, J. L. Tymoczko . 2005. Biochemia. PWN. Warszawa
T.A. Brown.2001 i nowsze. Genomy. PWN Warszawa
Czasopisma fachowe polsko- i angielskojęzyczne
Uniwersytet Śląski w Katowicach
Wydział
nazwa
Konsultacje
prowadzący
grupa(-y)
treści zajęć
metody
prowadzenia
zajęć
liczba godzin
dydaktycznych
(kontaktowych)
liczba godzin
pracy własnej
studenta
opis pracy
własnej
studenta
organizacja
zajęć
literatura
obowiązkowa
literatura
uzupełniająca
str. 4
kod
0310-CH-S2-L057_fs_3
prof. dr hab. Jerzy Silberring; dr hab. Piotr Suder; dr Anna Bodzoń-Kułakowska
2 grupy konwersatoryjne dla przedmiotu B związanego ze specjalnością
Rozwiązywanie problemów z zakresu treści modułu, zgłaszanych przez studentów podczas
przygotowania opracowywania tematów konwersatoriów.
Indywidualne rozmowy ze studentami
5
dowolna
Student zapoznaje się z literaturą i zgłębia zagadnienia poruszane na wykładach oraz
niezbędne do przygotowania prezentacji.
Spotkania odbywająca się w pokojach konsultacyjnych w budynku WBiOŚ przy ulicy
Jagiellońskiej 28 w terminach, uzgodnionych wcześniej z prowadzącym drogą elektroniczną.
Dane kontaktowe przekazywane są studentom w trakcie spotkania organizacyjnego.
J.M. Berg, J. L. Tymoczko . 2005 i nowsze. Biochemia. PWN. Warszawa
R.K. Murray i wsp. 1995 i nowsze. Biochemia Harpera. PWN. Warszawa
T.A. Brown.2001 i nowsze. Genomy. PWN Warszawa
P. C. Turner, A. G. McLennen i in. 1999 i nowsze. Krótkie wykłady Biologia molekularna.
PWN. Warszawa
adres strony
www zajęć
informacje
dodatkowe
3. Opis sposobów weryfikacji efektów kształcenia modułu
nazwa
Prezentacja
kod(-y) zajęć
osoba(-y)
przeprowadzająca(-e)
weryfikację
grupa(-y)
wymagania
merytoryczne
kryteria oceny
kod
0310-CH-S2-L-057
_w_1
0310-CH-S2-L-057 _fs_1
prof. dr hab. Jerzy Silberring; dr hab. Piotr Suder; dr Anna Bodzoń-Kułakowska
2 grupy konwersatoryjne dla przedmiotu B związanego ze specjalnością
Każdy student przygotowuje w trakcie semestru 3 prezentacje w języku polskim, pracując
w zespołach 2-osobowych.
Ocena każdej prezentacji w skali punktowej 0-5, z przeskokiem co 0,5.
5 punktów – prezentacja jest prawidłowo przygotowana pod względem merytorycznym i
graficznym, pozbawiona błędów ortograficznych, przedstawiane treści maksymalnie
wyczerpują opracowywany temat (prezentacja obejmuje spis wykorzystanej w pracy
literatury), student prezentuje przygotowany materiał bez posiłkowania się dodatkowymi
Uniwersytet Śląski w Katowicach
Wydział
przebieg procesu
weryfikacji
informacje
dodatkowe
materiałami, umie precyzyjnie i jasno odpowiedzieć na zadawane dodatkowo pytania lub
pojawiające się wątpliwości pozostałych uczestników dyskusji
4 punkty – prezentacja jest prawidłowo przygotowana pod względem merytorycznym i
graficznym, pozbawiona błędów ortograficznych, przedstawiane treści maksymalnie
wyczerpują opracowywany temat (prezentacja obejmuje spis wykorzystanej w pracy
literatury), student prezentuje przygotowany materiał czytając tekst wcześniej
przygotowany, nie potrafi precyzyjnie i jasno odpowiedzieć na zadawane pytania lub
pojawiające się wątpliwości pozostałych uczestników dyskusji
3 punkty – prezentacja jest prawidłowo przygotowana pod względem merytorycznym , ale
zawiera błędy ortograficzne i jakość graficzna jest obniżona ,przedstawiane treści nie
wyczerpują maksymalnie opracowywanego tematu, student prezentuje przygotowany
materiał czytając tekst wcześniej przygotowany, nie potrafi precyzyjnie i jasno
odpowiedzieć na zadawane pytania lub pojawiające się wątpliwości pozostałych
uczestników dyskusji;
2 punkty – prezentacja zawiera błędy merytoryczne, ewentualnie ortograficzne; jakość
graficzna przygotowanych slajdów jest/nie jest obniżona; przedstawiane treści nie
wyczerpują maksymalnie opracowywanego tematu, student prezentuje przygotowany
materiał czytając tekst wcześniej przygotowany, potrafi/nie potrafi precyzyjnie i jasno
odpowiedzieć na zadawane pytania lub pojawiające się wątpliwości pozostałych
uczestników dyskusji
1-punkt - prezentacja zawiera liczne błędy merytoryczne i ortograficzne; jakość graficzna
przygotowanych slajdów jest obniżona; prezentowane treści tylko w niewielkim stopniu
odzwierciedlają dostępne dane literaturowe, student prezentuje przygotowany materiał
czytając tekst wcześniej przygotowany, nie potrafi precyzyjnie i jasno odpowiedzieć na
zadawane pytania lub pojawiające się wątpliwości pozostałych uczestników dyskusji
0 punktów – brak przygotowania prezentacji multimedialnej i/lub jej przedstawienia.
Ocena wygłoszonych prezentacji odbywa się bezpośrednio po ich wygłoszeniu oraz
zakończeniu dyskusji. Oceny są przekazywane studentom w trakcie trwania
konwersatoriów, a następnie przekazywane drogą elektroniczną na wskazanych przez
studentów adres mailowy.
Wybór tematów prezentacji jest dobrowolny i odbywa się na przynajmniej na 7 dni
przed terminem ich wygłoszenia.
nazwa
Kolokwium zaliczeniowe z wykładów
kod(-y) zajęć
osoba(-y)
przeprowadzająca(-e)
weryfikację
grupa(-y)
wymagania
merytoryczne
kryteria oceny
przebieg procesu
weryfikacji
str. 5
kod
0310-CH-S2-L057_w_2
0310-CH-S2-L-057_fs_2
prof. dr hab. Jerzy Silberring; dr hab. Piotr Suder; dr Anna Bodzoń-Kułakowska
2 grupy konwersatoryjne dla przedmiotu B związanego ze specjalnością
Na kolokwium pisemnym obowiązują treści, obejmujące głównie zagadnienia
prezentowane podczas wykładów. Dopuszcza się możliwość włączenia do pytań treści,
prezentowanych i omawianych podczas konwersatoriów.
Kolokwium pisemne składa się z 30 pytań zamkniętych, wśród których prawidłowa jest
tylko jedna odpowiedź prawidłowa. Każde prawidłowa odpowiedź punktowana jest 0,5
punktem.
Test, stanowiący kolokwium pisemne z wykładów, trwa maksymalnie 60 minut. Studenci
udzielają odpowiedzi na nartach odpowiedzi. Bezpośrednio po zakończeniu testu zliczane
są punkty i przeliczane na ocenę zgodnie z kryteriami: 8 -9 pkt - ocena dostateczna (3,0);
9,5 -11 - ocena plus dostateczna (3,5); 11,5-12,5 - ocena dobra (4,0); 13-14 - ocena plus
dobra (4,5); 14,5 - 15 - ocena bardzo dobra (5,0). Wyniki udostępniane są studentom
Uniwersytet Śląski w Katowicach
Wydział
str. 6
bezpośrednio po zakończeniu weryfikacji, a następnie przekazywane drogą elektroniczną
na wskazanych przez studentów adres mailowy.
informacje dodatkowe
Istnieje możliwość bezpośredniego obejrzenia pracy po zakończeniu testu i
sprawdzenia zaproponowanych odpowiedzi, jak również konsultacji w związku z
obecnością wszystkich prowadzących wykłady na kolokwium zaliczeniowym.