Gram-ujemny QuickFISH™ BC
Transkrypt
Gram-ujemny QuickFISH™ BC
Badanie umożliwia szybką identyfikację pałeczek okrężnicy (E. coli), pałeczek ropy błękitnej (P. aeruginosa) oraz pałeczek zapalenia płuc (K. pneumoniae) na rozmazach wykonanych z pozytywnych posiewów krwi. Zasada postępowania Mieszanina znakowanych fluoresceiną sond PNA charakterystycznych dla pałeczek okrężnicy (E. coli), znakowanych tetrametylorodaminami sond PNA charakterystycznych dla pałeczek ropy błękitnej (P. aeruginosa) oraz znakowanych fluoresceiną i tetramethylrhodaminą sond PNA charakterystycznych dla Pałeczki zapalenia płuc (K. pneumoniae) są dodawane do rozmazu wykonanego z dodatniego posiewu krwi. Hybrydyzacja przeprowadzana jest w temp. 55°C przez 15 minut, a rozmaz jest badany za pomocą mikroskopii fluorescencyjnej. Gram-ujemny QuickFISH™ BC Pałeczki okrężnicy (Escherichia coli), pałeczki zapalenia płuc (Klebsiella pneumoniae) oraz pałeczki ropy błękitnej (Pseudomonas aeruginosa) Zestaw do identyfikacji posiewów C V X h Odczynniki Zestaw Gram-ujemny QuickFISH BC FISH składa się z następujących elementów: Gram-ujemny niebieski roztwór PNA 0,85 ml sonda PNA w roztworze Gram-ujemny niebieski PNA hybrydyzacyjnym. Zawiera 15% formamidu. 25 Gram-ujemny żółty PNA QFGNRBC1-25 Środki ostrożności V Przeznaczenie Do diagnozowania in vitro. Wyłącznie do profesjonalnego użytku, do stosowania przez personel przeszkolony w zakresie technik laboratoryjnych i doświadczony w zakresie mikroskopii fluoroscencyjnej. Gram-ujemna QuickFISH BC to wielokolorowy test jakościowy hybrydyzacji kwasów nukleinowych, przeznaczony do identyfikacji pałeczek okrężnicy (Escherichia coli) i/lub pałeczek ropy błękitnej (Pseudomonas aeruginosa) i/lub pałeczek zapalenia płuc (Klebsiella pneumoniae) na rozmazach wykonanych z pozytywnych posiewów krwi zawierających Gram-ujemne pałeczki bacilli przy barwieniu metodą Grama. Środki bezpieczeństwa Gram-ujemny niebieski i żółty roztwór PNA zawierają 15% formamidu. Mogą działać szkodliwie na dziecko w łonie matki. Chronić przed dziećmi. Unikać narażenia - przed użyciem zapoznać się ze specjalnymi środkami ostrożności. Karta charakterystyki substancji niebezpiecznej jest dostępna na żądanie. Przeprowadzenie podhodowli pozytywnych posiewów krwi jest konieczne do odzyskania drobnoustrojów celem przebadania czułości i/lub różnicowania mieszanego wzrostu. QuickFix-1 zawiera 24% etanolu: drażniący dla oczu i skóry. Pary mogą wywoływać uczucie senności i zawroty głowy. Karta charakterystyki substancji niebezpiecznej jest dostępna na żądanie. Środek dostępny w zestawie utrwalającym QuickFISH. Użycie Gram-ujemnego zestawu QuickFISH BC jest wskazane jako pomoc w diagnostyce bakteriemii wywołanej przez pałeczki okrężnicy (E. coli) i/lub pałeczki zapalenia płuc (K. pneumoniae) i/lub pałeczki ropy błękitnej (P. aeruginosa). V Gram-ujemny żółty roztwór PNA 0,85 ml sonda PNA w roztworze hybrydyzacyjnym. Zawiera 15% formamidu. QuickFix-2 zawiera 97% metanolu: wysoce łatwopalny. Działa toksycznie przez drogi oddechowe, w kontakcie ze skórą i po połknięciu. Karta charakterystyki substancji niebezpiecznej jest dostępna na żądanie. Środek dostępny w zestawie utrwalającym QuickFISH. Zapewnić ochronę przed zagrożeniem mikrobiologicznym. Do diagnozowania in vitro. Podsumowanie i wyjaśnienie Nie jeść, nie pić, nie palić, nie stosować kosmetyków, nie przechowywać ani nie przygotowywać żywności w wyznaczonym miejscu pracy. Pałeczki okrężnicy (E. coli), pałeczki ropy błękitnej (P. aeruginosa) oraz pałeczki zapalenia płuc (K. pneumoniae) są uważane za przyczyny bakteriemii nabytej pozaszpitalnie lub w szpitalu. Usuwać odczynniki zgodnie z krajowymi, wojewódzkimi i miejscowymi przepisami. Techniczne środki ostrożności Identyfikacja pałeczek okrężnicy (E. coli), pałeczek ropy błękitnej (P. aeruginosa) oraz pałeczek zapalenia płuc (K. pneumoniae) w posiewach krwi opiera się rutynowo na identyfikacji wstępnej jako Gram-ujemnych pałeczek bacilli (GNB), po której następuje ostateczna identyfikacja po wykonaniu podhodowli i analizy biochemicznej (1). Nie należy używać odczynników po upływie terminu ważności wydrukowanego na etykietach. Odczynniki dostarczone są w stałych stężeniach. Wszelka modyfikacja odczynników lub ich przechowywanie w warunkach niezgodnych z zaleceniami podanymi w punkcie „Przechowywanie i przygotowywanie elementów zestawu” może negatywnie wpłynąć na wyniki analizy. Gram-ujemny QuickFISH to wielokolorowy test fluorescencyjnej hybrydyzacji in situ (FISH), wykorzystujący sondy hybrydyzacyjne PNA do wykrywania sekwencji rybosomowych RNA charakterystycznych dla pałeczek okrężnicy (E. coli), pałeczek ropy błękitnej (P. aeruginosa) oraz pałeczek zapalenia płuc (K. pneumoniae), wliczając w to trzy podgatunki: pneumoniae, ozaenae oraz rhinoscleromatis. Unikać mikrobiologicznego skażenia odczynników. Unikać wszelkiego krzyżowego skażenia próbek i odczynników, ponieważ może to prowadzić do uzyskania błędnych wyników. 1 Nie dopuścić, aby końcówka pipety dotykała rozmazu, ponieważ może to spowodować krzyżowe skażenie materiału z różnych szkiełek mikroskopowych lub skażenie odczynnika. Niezwłocznie umieścić kroplę QuickFix-1 na próbce i równomiernie ją rozprowadzić na całym obszarze próbki za pomocą plastikowej igły do posiewu. Uważać, by nie tworzyły się pęcherzyki powietrza. Przy każdej próbce należy używać nowej końcówki pipety oraz igły do posiewu. Pozostawić rozmaz do wysuszenia (1-3 minut). Rozmaz powinien być widocznie suchy. Nie stosować filtrów mikroskopowych innych niż filtry marki AdvanDx (AC007). Dodać dwie krople QuickFix-2 na środek obszaru próbki. Patrz odnośnik na schemacie Nr 1 szkiełka QuickFISH. Nie stosować szkiełek mikroskopowych innych niż szkiełka QuickFISH Slides (CS012). Pozostawić rozmaz do wysuszenia (~1 minuty). Rozmaz powinien być widocznie suchy. Należy pamiętać, aby uchwyt na szkiełka AdvanDx SlideStation 10 był wypoziomowany i zrównoważony do temp. 55 ± 1°C przed rozpoczęciem procedury badania. Utrwalony rozmaz QuickFISH może być pozostawiony na podgrzewaczu szkiełek w temp. 55 ± 1°C przez maksymalnie 5 minut. Przygotowane rozmazy nieużyte w ciągu 5 minut mogą być przechowywane w temperaturze pokojowej do momentu badania, jeżeli okres oczekiwania nie przekracza 1 godziny, lub w temp. 2-8°C, jeżeli okres oczekiwania na badanie nie przekracza 1 dnia. Ważne jest, aby mikroskop właściwie funkcjonował. Należy upewnić się, że żarówka mikroskopu jest odpowiednio ustawiona i nie przekroczyła podanego okresu ważności. Schemat szkiełka QuickFISH: Źródła światła inne niż wysokociśnieniowa łukowa lampa rtęciowa nie odznaczają się na ogół odpowiednim spektrum emisji ani natężeniem oświetlenia, a w związku z tym nie zaleca się ich stosowania. Przed podaniem wyników odnoszących się do jakiegokolwiek źródła światła, należy się upewnić, że kontrola pozytywna prawidłowo wyświetla trzy odrębne barwy fluorescencyjne: zieloną, czerwoną i żółtą. Przechowywanie i przygotowywanie elementów zestawu Aby zapewnić uzyskanie optymalnych wyników za pomocą zestawu, jego elementy składowe powinny być przechowywane zgodnie z następującymi instrukcjami: Elementy składowe zestawu należy przechowywać w temp. 2-8°C. Przechowywać butelki w pozycji pionowej i dokręcać nakrętki po użyciu. Dostarczone odczynniki są gotowe do użycia. Procedura testu Szkiełka mikroskopowe QuickFISH są szczelnie zamknięte w oddzielnych torebkach z azotem i środkiem osuszającym. Przechowywać szkiełka mikroskopowe w temp. 2-8°C. Szkiełka mikroskopowe powinny być użyte natychmiast po zerwaniu szczelnego zamknięcia torebki. Nie używać szkiełek mikroskopowych po upływie terminu ważności. Dostarczony materiał Gram-ujemny QuickFISH BC QFGNRBC1-25 Każdy zestaw zawiera materiał wystarczający do przeprowadzenia 25 testów. Dostarczone odczynniki są gotowe do użycia. Data ważności zestawu jest podana na etykiecie zewnętrznego pudełka. Pobieranie i przygotowywanie próbki Wymagany materiał dostępny w firmie AdvanDx. Przygotowanie Gram-ujemnych rozmazów QuickFISH Gram-ujemny QuickFISH BC nie jest kompatybilny z podłożami do posiewu krwi zawierającymi węgiel ani z butelkami z posiewem krwi VersaTREK REDOX 2 Duże szkiełka nakrywkowe 50 x 24 mm numer 1. Szklane szkiełko nakrywkowe Filtr mikroskopowy AdvanDx Dwuzakresowy filtr Należy postępować zgodnie z instrukcjami producenta posiewu krwi, aby odpowiednio zmieszać posiew krwi w butelce przed wykonaniem rozmazu. Uchwyt na szkiełka AdvanDx SlideStation 10 Podgrzewacz do szkiełek (55 ± 1°C). AC028 Uchwyt na szkiełka nakrywkowe QuickFISH do mieszania AC030 Może pomieścić do 3 szkiełek przykrywkowych celem zmieszania Gramujemnego żółtego odczynnika PNA z niebieskim Szkiełko mikroskopowe należy umieścić na uchwycie na szkiełka SlideStation w temp. 55 ± 1°C. W przypadku wielu próbek należy upewnić się, że szkiełka mikroskopowe nawzajem się nie dotykają, aby uniknąć skażenia. Pipeta AdvanDx 10 µl Pipeta o stałej pojemności 10 µL. Szkiełko QuickFISH Szkiełko mikroskopowe QuickFISH z kontrolami QuickFix-1 Pierwotny roztwór utrwalający* QuickFix-2 Wtórny roztwór utrwalający* Nie dopuścić, aby końcówka pipety dotykała rozmazu, ponieważ może to spowodować krzyżowe skażenie materiału z różnych szkiełek mikroskopowych lub skażenie odczynnika. Dodać 1 lub więcej kropli próbki posiewu krwi do wtórnego naczynia (np. probówki mikrowirówkowej). Fiołka filtracyjna AdvanDx AC027 AC007 AC029 CS012 CP0169 CP0170 AC008 * SzkiełkoQuickFISH, QuickFix-1 oraz QuickFix-2 są dostarczone wraz z zestawem utrwalającym QuickFISH. o W przypadku próbek zawierających kuleczki żywicy – należy dodać 10 lub więcej kropli próbki do fiolki filtracyjnej AdvanDx. Nie przekraczać górnej granicy wypełnienia. Włożyć tłok filtra do fiolki i przesunąć go do końca celem usunięcia kuleczek żywicy. Wymagany, ale niedostarczony materiał Mikroskop fluorescencyjny wyposażony w obiektyw immersyjny o powiększeniu 60x lub 100x oraz wysokociśnieniowe łukowe lampy rtęciowe lub równoważne źródło światła. o Zdjąć wieczko z fiolki filtracyjnej AdvanDx, aby uzyskać dostęp do próbki i przygotować rozmaz. Olejek immersyjny. Powinien być zgodny z obiektywem mikroskopowym i niewykazujący fluorescencji. Upewnić się, że próbka posiewu krwi jest właściwie wymieszana. Za pomocą pipety AdvanDx 10 µl przenieść 10 µl próbki na środek obszaru próbki szkiełka QuickFISH. Patrz odnośnik na schemacie Nr 1 szkiełka QuickFISH. Końcówki do pipet 2 Plastikowe igły do posiewu. Materiał kontrolny powinien być przetestowany zgodnie z wytycznymi lub wymaganiami przepisów miejscowych, wojewódzkich i/lub krajowych, bądź organizacji akredytujących. Procedura analizy: Rozmazy QuickFISH powinny być przebadane natychmiast po ich utrwaleniu; jednak w przypadku przechowywania ich w temp. 2-8 °C lub w temperaturze pokojowej, należy umieścić je na podgrzewaczu szkiełek na ok. 5 minut w temp. 55 ± 1°C przed dodaniem odczynników hybrydyzacji. Stosować szkiełka mikroskopowe z kontrolami QuickFISH (CS012). Szkiełka mikroskopowe QuickFISH są szczelnie zamknięte w oddzielnych torebkach z azotem i środkiem osuszającym. Przechowywać szkiełka mikroskopowe w temp. 2-8°C. Szkiełka mikroskopowe powinny być użyte natychmiast po zerwaniu szczelnego zamknięcia torebki. Nie używać szkiełek mikroskopowych po upływie terminu ważności. Należy pamiętać, aby uchwyt na szkiełka AdvanDx SlideStation-10 był wypoziomowany i zrównoważony do temp. 55 ± 1°C przed rozpoczęciem procedury badania. Należy korzystać z wyświetlacza cyfrowego i termometru powierzchniowego (dostarczonych wraz z zestawem), aby się upewnić, że temperatura uchwytu na szkiełka SlideStation 10 wynosi 55 ± 1°C. Kontrola pozytywna wykaże liczne pałeczki bacilli o zielonym, czerwonym lub żółtym zabarwieniu fluorescencyjnym. Negatywna kontrola nie będzie zawierać komórek o zabarwieniu fluorescencyjnym. Pozytywne (POS, +) i negatywne (NEG, -) zagłębienia kontrolne zawierają organizmy reprezentatywne dla wszystkich zestawów AdvanDx QuickFISH BC. Organizmy kontrolne z innych zestawów mogą być słabo widoczne (bez fluorescencyjnego zabarwienia) zarówno w pozytywnych jak i negatywnych zagłębieniach kontrolnych. Hybrydyzacja Umieścić szkiełko nakrywkowe w jednym z rowków uchwytu QuickFISH przeznaczonego do mieszania. Patrz Schemat Nr 1. Odwrócić i przytrzymać każdą butelkę, aby umożliwić utworzenie się kropli w kroplomierzu, a dopiero wtedy ścisnąć butelkę, aby uniknąć utworzenia się piany w mieszaninie hybrydyzacyjnej. Morfologia komórek może się różnić między próbkami i kontrolami ze względu na naturalne odchylenia. Jeżeli wyniki pozytywnych i negatywnych kontroli nie są zgodne z poniższą interpretacją wyników, wyniki badania będą nieważne i nie należy ich zapisywać w karcie pacjenta. Dodać kroplę Gram-ujemnego niebieskiego roztworu PNA na środek szkiełka nakrywkowego. Uwaga: owalne wycięcie rowka uchwytu QuickFISH przeznaczonego do mieszania wskazuje środek szkiełka nakrywkowego. Umieścić jedną kroplę Gram-ujemnego żółtego roztworu PNA bezpośrednio na wierzchu pierwszej kropli. Uważać, by nie tworzyły się pęcherzyki powietrza. Patrz Schemat Nr 1. Ustawianie kontroli: Wyrównać środek obiektywu mikroskopu za pomocą punktów pozytywnego zagłębienia kontrolnego POS (+) na preparacie QuickFISH (Patrz schemat szkiełka QuickFISH). Przesunąć szkiełko do przodu lub do tyłu, tak aby zielony kontur zagłębienia pojawił się w polu widzenia. Użyć śruby mikrometrycznej, aby wyostrzyć obraz zielonego konturu zagłębienia (to jest prawidłowa płaszczyzna ogniskowa do odczytywania szkiełek mikroskopowych). Przesunąć obiektyw do środkowej części wybranego, pozytywnego zagłębienia kontrolnego POS. Aby zobaczyć negatywną kontrolę (NEG), należy przesunąć obiektyw w bok, do środka negatywnego zagłębienia kontrolnego NEG. Kontynuować ruch w bok, aby dojść do pola widzenia zagłębienia próbki. Dokładnie wymieszać niebieski PNA z żółtym za pomocą plastikowej igły do posiewu, aż do uzyskania jednolitego zielonego koloru albo pozostania nieokreślonego niebieskiego lub żółtego koloru. Rozprowadzić wzdłużnie celem wypełnienia owalnego wzornika. Patrz Schemat Nr 2. Schemat Nr 1 Schemat Nr 2 Uwagi dotyczące procedury Główne systemy posiewów krwi oraz zgodność rodzajów butelek: Platforma QuickFISH jest kompatybilna z dostępnymi na rynku systemami stałego monitorowania posiewów krwi oraz rodzajami butelek, za wyjątkiem butelki z dodatkiem węgla oraz butelki anaerobowej VersaTREK Redox 2. Przebadano następujące rodzaje butelek: Klinicznie: BacT/Alert (SA, SN), BACTEC (lityczna 10 anaerobowa, aerobowa plus, aerobowa standardowa 10) Nałożyć szkiełko nakrywkowe i docisnąć je, wyrównując krawędzie zgodnie ze znacznikami na szkiełku podstawowym. Szkiełko nakrywkowe powinno się mieścić między znacznikami. Jeżeli szkiełko nakrywkowe znajduje się na białym, matowym obszarze, test może zakończyć się niepowodzeniem ze względu na niewystarczający przepływ odczynników. Analitycznie: Poddać inkubacji przez 15-20 minut w temp. 55 ± 1°C. Aerobowa VersaTREK REDOX 1, BACTEC (Plus anaerobowa, aerobowa standardowa 10, anaerobowa/standardowa F, pediatryczna Peds Plus). Nie zostały oszacowane wyniki uzyskane za pomocą zestawu Gram-ujemnego QuickFISH BC przy użyciu tych rodzajów butelek z posiewami krwi. Uwaga: Unikać krzyżowego skażenia butelek. Umieścić każde wieczko kroplomierza na właściwej butelce. Kontrola temperatury: Sprawdzić szkiełka zgodnie z poniższym opisem Uwaga: Unikać krzyżowego skażenia butelek. Umieścić każde wieczko kroplomierza na właściwej butelce. Sprawdzić szkiełka zgodnie z poniższym opisem. Należy pamiętać, aby uchwyt na szkiełka AdvanDx SlideStation 10 był wypoziomowany i zrównoważony do temp 55 ± 1°C przed rozpoczęciem procedury badania Interpretacja wyników Preparaty powinny być ocenione w ciągu 2 godzin po hybrydyzacji. Nie wystawiać szkiełek na bezpośrednie działanie promieni słonecznych czy też silnego źródła światła, ponieważ może to spowodować wygaszenie fluorescencji. Kontrola jakości Kontrola jakości powinna być przeprowadzona przy każdym wykonaniu testu fluorescencyjnego. 3 Przeanalizować szkiełka za pomocą mikroskopu fluorescencyjnego wyposażonego w filtr mikroskopowy formy AdvanDx. Tło rozmazu jest czerwonawe. Pałeczki okrężnicy (E. coli) są widoczne w postaci licznych pałeczek bacilli o jasnym zielonym zabarwieniu fluorescencyjnym w wielu polach widzenia, podczas gdy pałeczki ropy błękitnej (P. aeruginosa) są widoczne w postaci licznych pałeczek bacilli o jasnym czerwonym zabarwieniu fluorescencyjnym w wielu polach widzenia, a pałeczki zapalenia płuc (K. pneumoniae) są widoczne w postaci licznych pałeczek bacilli o jasnym żółtym zabarwieniu fluorescencyjnym w wielu polach widzenia. Gram-ujemne pałeczki bacilli, inne niż pałeczki okrężnicy (E. coli), pałeczki zapalenia płuc (K. pneumoniae) i pałeczki ropy błękitnej (P. aeruginosa), nie wykazują fluorescencji. Unoszące się organizmy lub zanieczyszczenia nie powinny być interpretowane czy też mylone z pozytywnymi organizmami. Butelki anaerobowe BACTEC Plus oraz pediatryczne BACTEC Peds Plus nie zostały dokładnie ocenione w trakcie badań klinicznych, dlatego też nie ustalono w odpowiedni sposób wyników, jakie mogą przynieść Wyniki uzyskane przy użyciu butelek z posiewami krwi VersaTREK REDOX 1 oraz BACTEC (aerobowa standardowa 10, anaerobowa/ standardowa F) zostały oszacowane jedynie w badaniu zgodności do użytku wewnętrznego. Dlatego też nieznane są wyniki, jakie mogą dawać. Fałszywie pozytywna zielona autofluorescencja może wystąpić w przypadku użycia standardowego filtra FITC zamiast filtra mikroskopowego firmy AdvanDx. Fałszywie negatywne wyniki mogą sporadycznie wystąpić z powodu mieszanego wzrostu lub błędu w technice badania. Rodzaj, a także stan używanego instrumentarium wpływa na wygląd uzyskanego obrazu. Fluorescencja może się różnić zależnie od rodzaju używanego mikroskopu, źródła światła oraz poziomu rRNA w komórkach. Każde laboratorium powinno ustalić swoje własne kryteria do odczytywania wyników, przy zastosowaniu własnych kontroli. Przykłady reprezentatywne: zielony pozytywny wynik pałeczek okrężnicy (E. coli) (u góry po lewej); żółty pozytywny wynik pałeczek zapalenia płuc (K. pneumoniae) (u góry pośrodku); czerwony pozytywny wynik pałeczek ropy błękitnej (P. aeruginosa) (u góry po prawej); mieszany zielony pozytywny wynik pałeczek okrężnicy (E. coli), żółty pozytywny wynik pałeczek zapalenia płuc (K. pneumoniae) i czerwony pozytywny wynik pałeczek ropy błękitnej (P. aeruginosa) (u dołu po lewej). Negatywne wyniki testu z czerwonawym tłem (u dołu pośrodku). Fałszywie negatywny wynik pałeczek zapalenia płuc (K. pneumoniae) lub fałszywie pozytywny zielony wynik, prowadzące do błędnego rozpoznania pałeczek zapalenia płuc (K. pneumoniae jako pałeczek okrężnicy (E.Coli), mogą wystąpić w przypadku użycia innego źródła światła niż wysokociśnieniowa łukowa lampa rtęciowa, takiego jak zmodyfikowana łukowa lampa rtęciowa (metalohalogenkowa) lub dioda elektroluminescencyjna. Rozwiązywanie problemów Należy dokonać izolacji na podłożach stałych w celu zróżnicowania mieszanego wzrostu z innymi organizmami i zidentyfikowania pozytywnych posiewów krwi, dających negatywne wyniki FISH. Fałszywie pozytywne i/lub negatywne wyniki kontroli oraz badania próbki mogą być uzyskane, jeśli nie stosuje się filtra mikroskopowego firmy AdvanDx (AC007) lub w razie skażenia próbek. Niniejszy produkt nie został zatwierdzony do użycia z próbkami innymi niż posiewy krwi. Fałszywie negatywne wyniki kontroli lub badania próbki mogą być uzyskane, jeśli nie stosuje się szkiełek mikroskopowych AdvanDx QuickFISH (CS012) lub jeżeli brakuje ścisłej kontroli temperatury podczas hybrydyzacji. Oczekiwane wyniki Butelki z badanymi Gram-ujemnymi-dodatnimi posiewami krwi pochodziły od pacjentów z 5 ośrodków opieki zdrowotnej w Stanach Zjednoczonych i liczyły 306 posiewów krwi od 306 pacjentów, a także 43 wzbogacone próbki. W przypadku pałeczek okrężnicy (E. coli), pałeczek ropy błękitnej (P. aeruginosa) oraz pałeczek zapalenia płuc (K. pneumoniae), pozytywne wyniki badań klinicznych wahały się odpowiednio od 23% do 38%, od 0% do 12% i od 19% do 33%. Inne Gram-ujemne organizmy były widoczne w 25%-48% próbek. Prosimy zapoznać się z punktami „Środki ostrożności” i „Ograniczenia” w niniejszej ulotce lub skontaktować się z firmą AdvanDx. Nie jest konieczne zakładanie pokrywy na uchwyt na szkiełka (SlideStation), aby zapewnić właściwe działanie zestawu. Test może być wrażliwy na drobne zmiany związane z wielkością kropli Gram-ujemnego niebieskiego roztworu PNA oraz Gram-ujemnego żółtego roztworu PNA. W przypadku wypłynięcia piany z butelek, NIE NALEŻY ICH UŻYWAĆ, ale należy zdjąć szkiełko nakrywkowe i przygotować nowe przy użyciu nowych odczynników hybrydyzacji. Przedstawione wartości stanowią odsetek unikalnych posiewów krwi pacjenta (nie wliczono wielu próbek od tego samego pacjenta ani wzbogaconych próbek) jako odsetek tego, co było widoczne przy zastosowaniu rutynowych metod w stosunku do całkowitej liczby wszystkich gatunków widocznych w badaniach. Ograniczenia Wartości dotyczące pozytywnych lub negatywnych wyników na obecność gatunków uzyskanych za pomocą Gram-ujemnego QuickFISH BC mogą zależeć od ośrodka badawczego i grupy pacjentów (2). Gram-ujemny QuickFISH BC nie jest kompatybilny z podłożami do posiewu krwi zawierającymi węgiel ani z butelkami z posiewem krwi VersaTREK REDOX 2. Charakterystyka wyników Fałszywe zielone-pozytywne wyniki zostaną uzyskane z bakterią z gatunku Shigella. (grupy serologiczne A, B, C i D), Escherichia albertii oraz Escherichia fergusonii z powodu podobieństwa sekwencji rRNA. Butelki z badanymi Gram-ujemnymi-dodatnimi posiewami krwi pochodziły od pacjentów z 5 ośrodków opieki zdrowotnej w Stanach Zjednoczonych i liczyły 306 posiewów krwi od 306 pacjentów, a także 43 wzbogacone próbki. Wrażliwości Gram-ujemnego QuickFISH BC w porównaniu do rutynowych metod laboratoryjnych wynoszą 96,8% (91/94) dla pałeczek okrężnicy (E. coli), 98,1% (52/53) dla pałeczek ropy błękitnej (P. aeruginosa) oraz 100% (60/60) dla pałeczek zapalenia płuc (K. pneumoniae), a specyficzność butelek z pozytywnymi posiewami krwi zawierającymi Gram-ujemne pałeczki bacilli wynosi 99,0% (99/100). Fałszywe czerwone-pozytywne wyniki zostaną uzyskane z Brevundimonas diminuta, Herbaspirillum huttiense, Pseudomonas fulva, Acinetobacter radioresistens oraz kilkoma szczepami Pseudomonas putida. Fałszywe żółte-pozytywne wyniki zostaną uzyskane z Escherichia vulneris oraz Klebsiella variicola. Badania kliniczne przeprowadzono przy użyciu następujących butelek z posiewami krwi: BACTEC aerobowa Plus, BACTEC lityczna/10 anaerobowa, BacT/ALERT SA i SN. Nie ustalono wyników uzyskanych za pomocą Gram-ujemnego zestawu QuickFISH BC przy użyciu innych rodzajów butelek z posiewami krwi. 4 Wyniki kliniczne dla Gram-ujemnego QuickFISH BC w porównaniu z rutynową identyfikacją butelek z posiewem krwi zawierającym Gram-ujemne-dodatnie pałeczki bacilli. Pałeczki okrężnicy (E. coli) Gramujemny QuickFISH N=307 Pałeczki okrężnicy (E. coli) Pałeczki ropy błękitnej (P. aeruginosa) Pałeczki zapalenia płuc (K. pneumoniae) Negatywna 3 1 91 1,3 Ogółem Ośrodek 1 Ośrodek 2 Ośrodek 3 Pozytywna zgodność zielony 42/45 45/45 45/45 97,8% (132/135) Pozytywna zgodność czerwony 42/45 45/45 45/45 97,8% (132/135) 45/45 45/45 45/45 100% (135/135) Pałeczki ropy błękitnej (P. aeruginosa) Pałeczki zapalenia płuc (K. pneumoniae) Inne 0 0 0 0 1 Pozytywna zgodność żółty 0 Negatywna zgodność 42/45 45/45 45/45 97,8% (132/135) Ogólna zgodność 95,0% (171/180) 100% (180/180) 100% (180/180) 98,3% (531/540) 2 0 52 1 0 60 2 Pozytywna zgodność 96,8% (91/94) 95% CI (91,0-98,9) 1 Pozytywna zgodność 98,1% (52/53) 95% CI (90,1-99,7) 0 Pozytywna zgodność 100% (60/60) 95% CI (94,0-100) 3 99 Negatywna zgodność 99,0% (99/100) 95% CI (94,6-99,8) Podsumowanie wyników odtwarzalności w każdym dniu w 3 ośrodkach badań Obejmuje 9 posiewów krwi wzbogaconych o kliniczne szczepy pałeczek okrężnicy (E. coli). Obejmuje 34 posiewy krwi wzbogacone o kliniczne szczepy pałeczek ropy błękitnej (P. aeruginosa). 3 Obejmuje 1 mieszany posiew pałeczek okrężnicy (E. coli) i pałeczek zapalenia płuc (K. pneumoniae). 2 Butelki były przechowywane w temperaturze pokojowej po barwieniu metodą Grama i przed badaniem metodą QuickFISH. 17% próbek przetestowano w ciągu 2 godzin, 32% w ciągu 4 godzin, a 54% w ciągu 8 godzin. 45% próbek zostało przetestowanych w ciągu 8-48 godzin w przypadku barwienia metodą Grama, a 1% zostało zbadanych po upływie 48 godzin. Granica wykrywalności Analityczna czułość Gram-ujemnego QuickFISH BC mierzona jako granica wykrywalności testu dla pałeczek okrężnicy (E. coli), pałeczek ropy błękitnej (P. aeruginosa) oraz pałeczek zapalenia płuc (K. pneumoniae) została określona odpowiednio na około 2,3x105, 4,0x105 oraz 4,5x105 CFU/ml poprzez seryjne rozcieńczenia. Jest to zgodne z analityczną czułością innych metod barwienia opierających się na wykorzystaniu szkiełek mikroskopowych Dzień 1 Dzień 2 Dzień 3 Ogółem Pozytywna zgodność zielony 42/45 45/45 45/45 97,8% (132/135) Pozytywna zgodność czerwony 45/45 42/45 45/45 97,8% (132/135) Pozytywna zgodność żółty 45/45 45/45 45/45 100% (135/135) Negatywna zgodność 45/45 42/45 45/45 97,8% (132/135) Ogólna zgodność 98,3% (177/180) 96,7% (174/180) 100% (180/180) 98,3% (531/540) Bibliografia Specyficzność i czułość analityczna (niejednorodność) 1. Baron, E.J. 1998. Przetwarzanie danych z posiewów krwi i ich interpretacja, rozdz. 2.3. In: H.D. Isenberg (Ed.) Podstawowe procedury w mikrobiologii klinicznej, ASM Press, Washington DC. Gram-ujemny QuickFISH BC został przetestowany na 152 referencyjnych i klinicznych szczepach, obejmujących 16 szczepów pałeczek okrężnicy (E. coli), 21 szczepów pałeczek ropy błękitnej (P. aeruginosa) oraz 12 szczepów pałeczek zapalenia płuc (K. pneumoniae). Wszystkie 16 szczepów pałeczek okrężnicy (E. coli) przyniosło zielone pozytywne wyniki, wszystkie 21 szczepów pałeczek ropy błękitnej (P. aeruginosa) przyniosło czerwone pozytywne wyniki, a wszystkie 12 szczepów pałeczek zapalenia płuc (K. pneumoniae) przyniosło żółte pozytywne wyniki. Nie licząc tych trzech docelowych gatunków, badanie objęło 86 szczepów innych Gram-ujemnych pałeczek bacilli. Siedemdziesiąt osiem z nich przyniosło spodziewane negatywne wyniki. Kolejnych 5 szczepów przyniosło fałszywe pozytywne zielone wyniki: Escherichia albertii, Escherichia fergusonii oraz Shigella grupy serologiczne A, B C i D. Kolejne 3 szczepy przyniosły fałszywe pozytywne czerwone wyniki: Pseudomonas fulva (2 szczepy) oraz Acinetobacter radioresistens. Badanie objęło również 17 szczepów innych bakterii (11) oraz drożdży (6), z których każdy dał wynik negatywny. 2. Karlowsky JA, Jones ME, Draghi DC, Thornsberry C, Sahm DF, Volturo GA. 2004 r. Rozpowszechnienie i podatność przeciwbakteryjna bakterii izolowanych z posiewów krwi pacjentów hospitalizowanych w Stanach Zjednoczonych w 2002 r. Ann Clin Micro and Antibiol. 3(7). Definicje Odtwarzalność Poniżej zamieszczono wyniki trzydniowego badania odtwarzalności przeprowadzonego z zestawem Gram-ujemnym QuickFISH BC w 3 ośrodkach przez 2 osoby obsługujące w każdym z nich. h Kod produktu/numer katalogowy i Zapoznać się z instrukcją użycia X Zawiera materiał wystarczający do <n> testów M Wytwórca P Podsumowanie wyników odtwarzalności w każdym ośrodku badawczym w ciągu 3 dni 5 Upoważniony przedstawiciel H Zużyć do g Kod serii l Ograniczenia temperatury przechowywania Porady techniczne i obsługa klienta W razie pytań, prosimy o kontakt z AdvanDx lub lokalnym dystrybutorem. M P AdvanDx, Inc. 400 TradeCenter Suite 6990 Woburn, MA 01801 USA AdvanDx A/S Bygstubben 11 2950 Vedbæk Dania Tel: +1 781 376 0009 Faks: +1 781 376 0111 Tel: +45 45 16 07 99 Faks: +45 45 16 07 98 [email protected] www.PNA-FISH.com Wyprodukowano na licencji firmy Boston Probes, Inc. Produkt ten nie może być stosowany w cytochemii człowieka, wykorzystującej analizę na szkiełkach, w cytogenetyce nowotworów opierającej się na hybrydyzacji w tkance ani w cytometrii przepływowej. 07 lutego 2014 PN2293. Rewizja A Zakupienie tego zestawu jest równoznaczne z uzyskaniem licencji na jego stosowanie zgodnie z następującymi patentami: US 5,985,563; US 5,888,733; US 6,664,045; US 6,395,474; US 6,357,163; US 5,539,082; US 7,223,833; US 6,361,942; US 7,816,50; EP 862,650; EP 804,456 6